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Ob Inzucht prinzipiell als Vorgehensweise in der Zucht vertretbar ist, ist wohl eine Frage der ethischen Einstellung des jeweiligen Züchters. Wenn sie denn eingesetzt werden soll, muss sich der jeweilige über etwaige Folgen seines Tuns bewusst sein und auch die Konsequenzen dafür tragen können.
Abhängig von der Zucht mit "inzuchtbelasteten" Tieren ist mit Sicherheit auch der Grad der vorliegenden Inzucht, evtl. gesundheitliche Probleme und die genaue Kenntnis über die Eltern, Großelterntiere etc. sowie der Tatbestand, das es sich im Falle der Rennmaus um eine an sich bereits stark ingezüchtete Tierpopulation handelt.

Inzucht ohne eine ausführliche Dokumentation, ausführliches Hintergrundwissen über die betreffenden Tiere, die Inzucht an sich und ohne einen guten Grund ist in jeglicher Hinsicht abzulehnen. Das Fehlen eines geeigneten Zuchtpartners rechtfertigt noch lange nicht den Weg über die Inzucht. Ebenso wenig es mal ausprobieren zu wollen...
Die gezielte und sinnvoll angewendtete Inzucht gehört in erfahrene Profihände, die abschätzen können wie hoch oder niedrig das mit hinein gezüchtete Risiko ist, sowie auf mögliche "Überraschungen" vorbereitet sind. Zudem erfordert gezielt und sinnvoll angewendete Inzucht einen großen Tierbestand (ja, man mag es kaum glauben).

Durch Rückkreuzungen ist es möglich mehr über das (gesundheitliche) Erbgut der Elterntiere zu erfahren. Als "Kontrollsystem" kann die Inzucht hier gute Dienste leisten (ich selbst habe über diese Methode schon mehrere Defektträger in meiner Zucht entlarven können). Aber eine Zucht u. a. mit Hilfe von Inzucht-Methoden aufzubauen ist ein völlig anderes Paar Schuhe.

Linienzucht

Dieser Begriff fällt regelmäßig in Zusammenhang mit Inzucht und genauso regelmäßig sorgt er für Verwirrung.
Linienzucht beinhaltet immer ein Maß an Inzucht. In der Regel wird hier bewußt auf Inzestverpaarungen verzichtet, da sie züchterisch oft weniger wertvoll sind. Linienzucht sind Verwandtenzuchten, d.h. hier werden weitläufig Verwandte miteinander verpaart um gezielt bestimmte Eigenschaften zu festigen und zeitgleich durch viel Fremdtiereinzucht die genetische Varianz in der Linie hoch gehalten. Es werden mehrere Linien aufgebaut, die sich phänotypisch gleichen jedoch von unterschiedlicher Herkunft sind und miteinander gekreuzt werden um mit mehr oder weniger Erfolg den erwünschten Phänotyp zu festigen. Linienzucht ist sehr aufwendig und benötigt eine Vielzahl an Tieren um gute Ergebnisse bringen zu können.

Vorrangig wird sie eingesetzt wenn es um Erhaltungszucht bzw. Aufbau einer best. Population geht und/oder bestimmte Eigenschaften auf einem anderen Weg (Zucht über unverwandte Tiere) nicht erhalten werden können bzw. verloren gehen würden.

Um eine Linienzucht aufzubauen müssen etliche Punkte beachtet, viele Jahre Arbeit investiert werden. Über die Linienzucht allein könnte man einen ganzen Roman schreiben und wird deswegen hier nur kurz angeschnitten.
In diesem Rahmen ist diese Thematik nicht ansatzweise zu erfassen...